中共呼和浩特市委统战部设20个内设机构。

分别为：办公室、研究室、干部科、机关党委、一科、二科、三科、四科、五科、六科、七科、八科、九科、十科、十一科、离退休人员工作科、机关纪委、呼和浩特市归国华侨联合会、呼和浩特市委统战部综合保障中心、呼和浩特市宗教团体服务中心